lunes, 27 de febrero de 2012

TAREA TRANSPOSICION

  •  TRANSPOSICION

    Transposición: Cambio de posición de un elemento móvil en el genoma

  •  Función: solamente autoperpetuarse.

     Mecanismo de transposición

    • Similar a cortar y pegar en el ordenador:

      • Cortar el elemento (extremos romos)
      • Cortar el DNA en el sitio de integración (Extremos protuberantes)
      • Ligar el elemento en el nuevo sitio (3’ del IS al 5’ del DNA aceptor)
      • Rellenar y cerrar nick: DNA polimerasa y ligasa de la Bacteria (generación de repeticiones directas)
    • El cromosoma queda roto en el sitio original:

      • Reparación homóloga: no mutación
      • Reparación no homóloga: mutación
    • Transposición replicativa: no se pierde la localización original.

      Transposición conservativa: el transposón sale de la sede donadora que queda vacía y se incorpora en una nueva sede (sede receptora). No aumenta el número de copias del transposón en el interior de la célula.

       

      CLASIFICASION DE TRANSPOSICION

       Se expresa la transposasa, y realiza dos cortes de doble cadena a la misma altura en el genoma donante, dejando aislado el transposón. A continuación localiza una secuencia diana (pongamos, ATGCA) en el genoma aceptor, y realiza un corte cohesivo. Tras eso une los extremos a los del transposón aislado, y la ADN Polimerasa de la célula rellena las zonas de cadena sencilla dejadas en la secuencia señal tras el corte cohesivo. Debido a esto, la secuencia señal queda duplicada. Queda, sin embargo, un hueco en el genoma donante, que puede ser letal si no se repara. Realmente, en este caso se habla más de recombinación que de transposición.


       
      • Transposición no conservativa: en este caso la transposasa realiza un corte cohesivo no solo en la secuencia diana, sino también en el genoma donante, dejando un corte a cada lado del transposón. A continuación integra todo el genoma donante con el aceptor, mediante un curioso mecanismo que forma un intermediario llamado “estructura entrecruzada”. Esta estructura es resuelta por un segundo enzima, la resolvasa, que según cómo lo resuelva dará lugar a una de las siguientes transposiciones:
        • Transposición no replicativa: el genoma donante se libera, dejando el integrón en el genoma receptor. Al igual que en la transposición conservativa, queda un hueco en el genoma donante, que puede ser letal si no se repara.
        • Transposición replicativa: se produce una replicación desde los extremos 3’ del genoma aceptor, lo que acaba por duplicar el transposón, y produciendo un genoma mixto llamado “cointegrado”. A continuación la resolvasa rompe el cointegrado mediante una recombinación recíproca, que une los extremos del ADN aceptor original (ahora con una de las copias del integrón) y libera el genoma donante de nuevo con su transposón.

      BIBLIOGRAFIA

      • Kidwell, M.G. (2005). «Transposable elements.». En (ed. T.R. Gregory). The Evolution of the Genome. San Diego: Elsevier. pp. 165–22. ISBN 0-12-301463-8.
      • Craig NL, Craigie R, Gellert M, and Lambowitz AM (ed.) (2002). Mobile DNA II. Washington, DC: ASM Press. ISBN 978-1555812096.
      • Lewin B (2000). Genes VII. Oxford University Press.. ISBN 978-0198792765.
      • Thomas M Devlin. «Regulación de la expresión génica» (en español). Bioquímica: libro de texto con aplicaciones clínicas (4ª edición). Reverté. pp. 345. ISBN 84-291-7208-4. Consultado el 27 de enero de 2011.
      1. Dosne Pasqualini, Christiane (1991). «Reflexiones sobre la etiología de la leucemia». Revista Medicina 51 (2).
      2. «Elementos móviles en el genoma humano» (en español). Medicina molecular (26 de marzo de 2008). Consultado el 27 de enero de 2011.